منذ عدة أسابيع وخلال شهر يونية الماضي 2014 اكتشف دير القديس أنبا مقار أن المنطقة الصحراوية الأثرية ‏المحيطة بالدير والتي تحوي كلها آثار لمنشوبيات وقلالي قبطية أي مساكن الرهبان ومباني الخدمات للأديرة الأثرية ‏القديمة التي يعود تاريخها إلى القرن الرابع الميلادي، هذه الأرض التي تخضع لإشراف وزارة أو هيئة الآثار، وقد ‏أقامت الدير حارساً عليها باعتبارها متاخمة لحدود الدير وتخص صفته كدير كامتداد تاريخه لتاريخ هذه المنطقة ‏الأثرية ومبانيه الحديثة لمباني هذه المنطقة الأثرية القديمة، علماً بأن مثل هذه الأراضي الأثرية ممنوع بحكم القانون ‏تملُّكها أو الانتفاع بها مثل زراعتها أو بناء مباني عليها من أي نوع، هذه الأرض اكتشف الدير أن مجموعة من ‏البلطجية يتزعمهم أن شخص يدعى "جبريل سعد السنوسي" – من أصحاب السوابق الجنائية- وبصُحبته آخرين، ‏احتلوها أخيراً إذ قاموا بالاستيلاء على مساحة تُقدر بـ 500 فدان، وقاموا بحفر بئر وبناء حجرة وزراعة أشجار ‏فيكاس، وفرض أمر واقع بالقوة والتهديد، حيث أطلقوا الأعيرة النارية في وجود مسئولي وزارة الآثار وهددوا ‏الرهبان بحرق أراضي مملوكة للدير‎.‎

ومن حيث أنها أيضاً تحوي بقايا وآثاراً مطمورة تحت الأرض ولكن تظهر رؤوسها وقممها فوق سطح الأرض ‏وهي تعتبر من التراث التاريخي لمنطقة برية شيهيت أو ما تُسمَّى في المخطوطات القديمة باسم (أسقيط القديس ‏مقاريوس الكبير) التاريخي ‏‎ ‎منذ القرن الرابع، فإن هذه الأرض تُعتبر تراثاً تاريخياً ثميناً لا يصح أو يُسمح باستخدامه ‏أو بالاتتفاع منه من أي طرف. ومرفق صورة القرار الوزاري رقم 1149 لسنة 1996 ببيان الأرض الأثرية هذه ‏المحيطة بدير الأنبا مقار، وأنه بعد موافقة من وزارة الدفاع والمجلس الأعلى للآثار أصبح من الواجب على الدير بناء ‏سور حول أراضي هذه المنطقة الأثرية لحمايتها من التعديات‎.‎‏ علماً بأنه منذ سنة 1996 والدير يحاول بناء سور ‏ليحمي المنطقة الأثرية من التعدي ولكن المسئولين في هيئة الآثار تأخروا حتى الآن في تحديد ووضع العلامات حول ‏حدود الأرض ليمكن للدير الالتزام بها وبناء السور على هداها.

‏